* Prosna
o kanały:
+ północny – Bernardyński
+ południowy – Rypinkowski
o dopływy w granicach miasta – prawe:
+ Pokrzywnica
+ Swędrnia
o dopływy w granicach miasta – lewe:
+ Piwonia
+ Krępica
* stawy:
o Piwonicki (Piwonice)
o Trójka (Rypinek)
o U Grona (Zagorzynek)
o Zośka (Rypinek)
* zbiorniki retencyjne: Jezioro Pokrzywnickie (5 km na południowy wschód od Śródmieścia, na granicy miasta z gminą Opatówek), zbiornik Murowaniec (14 km na północny wschód, w gminie Koźminek), Jezioro Gołuchowskie (15 km na północny zachód, w gminie Gołuchów)